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[UE 1] Réplication | TD n°9, question 10, item E | Calcul..(Résolue)

Question

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Thomas3484
Membre
Médecine Montpellier
Bonsoir, est-ce que l'on pourrait me réexpliquer le résultat trouvé de 40,8 minutes ? Car j'ai beau le refaire, je trouve un temps de réplication de 81,7 minutes, en faisant simplement "Nombre de nucléotides" / "vitesse" (50Nt/sec) puis je divise par le nombre d'origine de réplication (1000), et je trouve donc 81,7 minutes. Merci d'avance :)
Par Thomas3484 le 07/12/2013 à 22h06 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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nidal
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Est ce que tu peux mettre l'énoncé stp, parceque on en n'a pas accès..
Par nidal le 08/12/2013 à 00h41 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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nidal
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Mais je pense qu'il faut diviser le résultat que tu obtiens par deux, n'oublie pas qu'a chaque fois t'auras 2 fourches (une sur chaque brin d'ADN).
Bref si tu trouves encore de difficultés, remets l'énoncé ça sera plus simple à expliquer!
Par nidal le 08/12/2013 à 00h47 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Thomas3484
Membre
Médecine Montpellier
Voici l'énoncé :
Concernant la réplication chez les eucaryotes :
Dans l’hypothèse ou il y aurait 1000 origines de réplication régulièrement réparties au niveau du chromosome 1 (de longueur 245 106 pb) sa réplication complète nécessiterait plus de 3 heures (on négligera la synthèse des télomères et on supposera que toutes les origines démarrent en même temps).
Par Thomas3484 le 10/12/2013 à 13h34 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Mathilde-b
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Salut,

Alors, on te dit qu'il y a 1000 origines pour 245*106pb, donc entre chaque origine, il y aura (245*106/1000)=245*103 paires de bases.
Et la attention il faut diviser par 2 pour calculer le tps mis puisque sur une fourche la polymérisation se fait dans les 2 sens pour un brin (polymérisation dans le sens de la fourche et dans l'autre sens grâce aux fragments d'Okasaki). Du coup, entre 2 fourches, il va y avoir une convergence de la polymérisation, et comme les polymérases ont la meme vitesse, elles vont se croiser au milieu du brin situé entre les 2 origines, donc chaque polymérase polymérise seulement (245000/2) bases.

Du coup T(s)=Nu/vitesse= 122500/50= 2450s =2450/60 min=40,8 min.

Tu as compris? Relance sinon :)
Par Mathilde-b le 10/12/2013 à 19h26 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Math345001
Membre
Médecine Montpellier
Bonsoir!

J'me permet de relancer :)

En prenant d'ADN orienté 3'----------->5'.
En supposant que la première origine débute au 1er nucléotide, on se retrouve avec un ADN coupé en 1000 morceaux égaux de 245000pb. Du coup, je suis d'accord que chaque ADNpol va lire que la moitié d'un brin (donc elles mettront (245000/(2*50)...40,88min), je suis d'accord).

Mais sur la 1000ème origine, l'ADNpol (3'------------Θ---5' Θ=1000ème origine), qui va donc de 3' vers 5', elle va être seule à polymériser un brin de 245000 pb, du coup, le temps de réplication va être deux fois plus long pour elle et cela déterminera donc le temps total de réplication soit (245000/(50*60))=81,67min.

Je m'étais fait la même réflexion. ^^'
Si tu pouvais éclairer notre lanterne :D

Kiss Love Piss !

Par Math345001 le 10/12/2013 à 22h31 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Mathilde-b
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Houla oui effectivement j'avais oublié qu'on était chez eucaryotes dsl! confus

Du coup, je pense qu'en fait qu'il y a une origine de réplication aux deux extrémités (au 1er et dernier nucléotides) et dans ce cas, le brin sera séparé en 999 segments. (Par exemple, si on a 6 origines de réplications, avec une origine sur chaque extrémité, le brin est séparé en 5 fragments).
Donc en fait, il y a entre chaque origine :245*106/999=245245 paires de bases.
A ce moment la, toutes les pol polymérisent 245245/2 bases.
T(s)=122622/50=2452s=40,87 min

Vous n'avez pas eu plus d'explication en TD?
Par Mathilde-b le 10/12/2013 à 23h44 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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