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[UE 1] Traduction | ... | Wobble : dégénescence : distance (Résolue)

Question

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Dingo
Membre
Médecine Montpellier
Bonjour

Je vous appelle à l'aide pour une diapo que je ne comprend pas dans le cours de Cornillot sur la traduction:

(Diapo 15 sur 85)

Jai ecris dans mes notes du cours que la dégénérescence au niveau de la 3eme base du codon et de la 1ere base de l'anti codon est un appariement non canonique (donc pas standard donc Wobble) et cad a dire pas GC/AU
Du coup je ne comprend pas quelle est la correspondance des bases ?
Quand on dit que l'ARNt se lit de 5'- 3' (ACG) et l'ARNm de 3'-5' (CGU) on ne tient pas compte de lordre du style : ACG, CAG des deux premières bases cest bien ça ??

En plus jai ecris que la distance etait plus grande à cause de la courbure de l'ARNt du à la dégénérescence
Est ce que c'est du au fait que ARNt se lit de 5'- 3' et l'ARNm de 3'-5' ?

Et en plus que la distance etait compatible au niveau d'energie de Watson et Qcrik, comment ça ?

Merci d'avance pour votre aide, je suis perdu dans le cours de Cornillot ...... Jespere arriver à me faire comprendre

Par Dingo le 17/11/2013 à 11h29 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Quantum
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Bonjour,
On va reprendre deux trois points puis répondre à ta question.
L'ARNm se lie de 5' en 3'. L'ARNt doit traduire l'information portée par l'ARNm. Or l'ARN et l'ADN forment des doubles brins de sens contraire. L'ARNt va donc s'aligner dans l'autre sens.
Ainsi :
Dans le sens 5'-3', si l'ARNt a comme anti-codon (les bases portées qui s'apparient) :5' AUG 3'. Alors le G sera en face de la premiere base du codon de l'ARNm, le U en second et le G en troisieme.


C'est clair pour ça ?

Si oui, continuons.

On a vu comment s'appariait notre ARNm et noter ARNt. C'est à dire en sens contraire. Mais il faut rajouter une derniere donnée, l'ARNt sera courbée et la distance avec la premiere base de l'ARNm sera moins importante que la deuxieme et encore plus de la troisieme.
Donc la troisieme base du codon est plus éloignée de sa base correspondante (premiere sur l'ARNt si tu as bien suivi !!).
Les liaisons faibles sont donc modifiées. Ainsi, un appariement canonique n'est pas obligatoire. Tu peux avoir un appariment un peu moins net, c'est le Wobble (=trenblement, pas très stable comme appariement).

Dans le Wobble, cette base de l'anticodon peut reconnaitre différente base de l'ARNm si les deux premieres correspondent. Ainsi un ARNt si il met en jeu une base du wobble qui reconnait plusieurs bases peut reconnaître différents codons !
C'est la dégénérescence des codons !

Bonnes révisions

Tuteur Stagiaire en UE1

Par Quantum le 04/12/2013 à 15h57 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Dingo
Membre
Médecine Montpellier
Merci pour tes explications ça a en partie répondue a mes question

mais du coup je ne comprends pas
quand on reprend l'Exemple du cours par exemple

ARNt : codé de 5'-3' : ACG

Anti codon correpondant : codé de 3'-5' : CGU


Donc de ça je comprends que:

A s'apparie/va je sais pas comment on dit avec C
C avec G
G avec U

Mais en fait ce que je comprends pas cest que dans la regle du Wobble

on nous dit :
G avec C
U avec A
G avec C ou U
U avec A ou G
I avec A, C ou U

( je ne fais que re-copier le tableau je ne sais pas comment faire pour l'insérer)

DONC je ne vois pas comment on trouve cet ARNm (CGU) pour ACG

Parce que du coup
A correspond avec quoi ?
C correspond avec quoi ?
G correspond avec quoi ?

Merci pour votre aide
je désespére
Par Dingo le 09/12/2013 à 17h15 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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CH3CH2OH
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Coucou je m'insère dans la conversation :)
En fait, il faut surtout pas oublier que TOUS LES BRINS SE LISENT DE 5' VERS 3' c'est la règle fondamentale.
Donc de 5'3' on a ACG
De 3'5' CGU. Maintenant, lui, tu dois le lire de 5' vers 3' donc ça te donne UGC.
Donc A s'apparie bien avec U
C s'apparie avec G
G s'apparie avec C

Est-ce que ça t'aide ?
Par CH3CH2OH le 10/12/2013 à 13h46 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Dingo
Membre
Médecine Montpellier
Ok je pense que je vois merci!
mais comment on fait quand ya un T dans la séquence ??
Par Dingo le 11/12/2013 à 00h52 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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CH3CH2OH
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Normalement il n'y en a pas parce qu'on est sur l'ARN et pas sur l'ADN, s'il y en a il sera pris en charge par les systèmes de réparation (cf Badia)
Par CH3CH2OH le 11/12/2013 à 09h38 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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