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[UE 1] Pont disulfure / Question rapide | ... | ?(Tuteurs remerciés)

Question

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julieedu34
Membre
Médecine Montpellier
Bonjour, y a un petit truc que je ne comprends pas ! Lorsqu'on cherche le nombre de chaines peptidiques, on nous donne le PM, puis en gel dénaturant le poids des bandes, et pour passer au nombre de chaines , on cherche les sommes du poids des bandes en condition dénaturante avec réducteur qui sont égales à celles des poids des bandes en condition dénaturantes ( je sais pas si je suis claire) , genre une bande de 100 kDa en condition dénaturante , pourra nous donner 2* 50kDa en condition dénaturante + réducteur.

Mais mon little problème est: lorsqu'on enlève les ponts disulfures intercaténaires, on ajoute deux hydrogènes non ?
Du coup toute la logique que l'on fait avec ce genre d'exercice n'est pas totalement vrai ?


Et tant que j'y suis à l'exercice :
" Soit une protéine de PM = 200000 Da qui contient 6 cystèines , et qui en gel dénaturant non réducteur apparait comme 2 bandes de PM de 60000 Da et 40000 Da.

A l'item " on peut dire que cette protéine n'a pas de pont disulfure intra-caténaire " noté FAUX. C'est faux, car on ne sait pas le nombre de pont intercaténaires, donc on peut pas connaitre celui des intra ? Mais cela ne veut pas forcement dire qu'il y en a , c'est ça ?
Par julieedu34 le 06/12/2012 à 12h57 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Alex-Bioch
Tuteur simple
Pharmacie Montpellier
Bonjour,

Alors pour le poids des hydrogènes j'avoue que je ne m'étais jamais posé la question ! Ne te prends surtout pas la tête avec ça ! Il est vrai oui qu'on rajoute deux hydrogènes pour réduire le pont disulfure et détacher tes chaînes mais tout n'est qu'approximation en terme de PM. C'est comme quand on te dit de calculer le PM d'une protéine, tu fais avec un PM moyen de 110 Da, on n'est pas dans l'exactitude même mais dans l'expérimental. On va pas chipoter avec 1 ou 2 Da :-P

Sinon pour l'histoire des ponts intra caténaires, puisque tu es seulement en conditions dénaturantes, ça ne te renseigne pas sur l'existence de ponts disulfures au sein de chaque monomère. Tu peux avoir des ponts disulfures inter- et intrachaînes. Donc effectivement, ne connaissant pas le nombre de ponts intercaténaires tu ne peux pas en déduire quoi que ce soit sur le nombre d'intracaténaires.

J'espère avoir répondu à ta question :-)

Alexandre TROUILLARD
Tuteur en UE1 Biochimie Structurale & Métabolique - UFR Pharmacie

Par Alex-Bioch le 06/12/2012 à 16h53 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Bakamed
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Surtout que bon, une différence de 2 Da sur des protéines de plusieurs dizaines ou centaines de milliers de dalton, c'est une microcouille de rien du tout^^

Médéric MICHEL, tuteur qualifié en UE1-TIG

Par Bakamed le 06/12/2012 à 17h04 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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julieedu34
Membre
Médecine Montpellier
Ahahh j'avoue que je chipote un peu :p mais cetais au cas où j'aurais raté un truc :p ! Merciiii :)
Par julieedu34 le 06/12/2012 à 17h44 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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