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[UE 1] colle 2 | qcm 3 | charge globale du peptide(Tuteurs remerciés)

Question

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imane
Membre
Pharmacie Montpellier
Bonsoir
concernant la colle 2 qcm 3 item D je ne sais pas comment résoudre ce genre d'exercice, comparer quoi à quoi pour avoir les charges, j'aimerai bien avoir une méthode général pour résoudre des autres exercices dans ce genre même à des PH et peptides différents parce que je me bloque souvent sur ça
Merci :)
Par imane le 27/11/2012 à 21h53 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Bakamed
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Je te passe un lien, lis les 2 premieres réponses que j avais faites, ça expliquait comment calculer la charge d'un peptide^^

http://www.lafed-um1.fr/faq-afficher-1795.html

Si ça te convient pas et que c'était pas vraiment ça que tu voulais savoir, hésite pas à relancer^^ Si après ces explications tu n arrives tjs pas à résoudre l exo de la colle avec les charges, hésite pas à me le copier coller et je t aide à le résoudre^^

Médéric MICHEL, tuteur qualifié en UE1-TIG

Par Bakamed le 28/11/2012 à 01h11 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
...
imane
Membre
Pharmacie Montpellier
Bonjour
alors j'ai essayé de faire le peptide TRAINEE à PH = 4 pkr de R = 11 et pkr de E = 4
d'après ce que j'ai compris à pkr de E on a 50% COO- et 50% COOH et à pkr de R on a 100% NH2 ,sachant que pka COOH = 2 et pkb NH2 = 9
et là je ne sais plus quoi faire !! à l'aide :p
Par imane le 28/11/2012 à 10h36 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Celine
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Salut

alors pour calculer la charge globale d'un peptide, il faut d'abord que tu regardes les acides aminés chargés que possède ce peptide. Ici, tu as bien vu qu'il n'y avait que R et E qui étaient des aa chargés. =)

Commençons d'abord par les extrémités N-ter et C-ter : ici ton ph est égal à 4. Sachant que le pka de la fonction COOH est de 2, tu te trouves ici avec un pka inférieur à ph-2 donc ta fonction COOH sera entièrement sous forme COO- (pour te représenter ça, essaye de te faire une flèche en positionnant dessus le pka avec à gauche les formes COOH et à droite les formes COO- et positionne ensuite le ph sur ta flèche, tu verra que tu te trouvera du côté COO-...).

Ensuite, pour la fonction NH2, ton pkb étant de 11, il est supérieur à ph+2 donc tu sera entièrement sous forme NH3+ (tu peux toujours te représenter la flèche avec le ph et le pkb^^). C'est deux fonctions s'annulent donc au niveau des charges, la charge de ton peptide ne dépendra que des charges des chaines latérales.

Pour l'arginine, son pkr est supérieur à ph+2 : là encore sa fonction NH2 sera entièrement sous forme NH3+ (charge = +1).

Pour la fonction COOH de l'acide glutamique, son pka est égal au ph, tu aura donc 50% de formes COOH et 50% COO- donc tu peux considérer que la charge de E à ph=4 est de -1/2. Comme dans ce peptide tu as deux E, l'addition de leurs charges est égale à -1.

Donc ici, les deux charges des chaines latérales s'annulent, ton peptide sera donc neutre à ph=4 !!! =)

J'espère que c'est plus clair pour toi,
bon courage !!! =)
Par Celine le 28/11/2012 à 20h00 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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imane
Membre
Pharmacie Montpellier
très bien expliqué ! c'est très clair
Merci beaucoup :D
Par imane le 28/11/2012 à 20h42 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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