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[UE 1] Lehmann | Charge globale | Charge globale(Tuteurs remerciés)

Question

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Sunnny
Membre
Médecine Nîmes
Bonsoir

J'ai un "léger" petit soucis. En effet les chaines laterales de Acides aminés qui peuvent se ioniser étant D,E,R,K,H,C pourquoi la charge globale du peptide MEDECIN n'est pas égale à -4?

Séance 5 qcm 3
B. Mis en solution à pH = 7, le peptide MEDECIN a une charge globale proche de -3. La reponse est vraie
Par Sunnny le 19/11/2012 à 19h00 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Bakamed
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Attention Lehmann a déjà insisté plusieurs fois dessus et il nous l'a redit quand on était en réunion avec lui:

La cystéine n'est PAS un acide aminé acide c'est juste l'acide aminé neutre le plus acide mais ce n'est pas un acide aminé acide donc à PH 7 il n'est pas ionisé! la charge est donc bien de -3

Les acides aminés acides (chargés- à PH7) sont D et E

Les acides aminés basiques (chargés + à PH7) sont R,K,H.

Il a dit que si il ne vous donnait pas le Pkr de la cystéine vous deviez le considérer comme neutre. Si il te donne le Pkr là oui tu pourras faire un calcul et trouver la charge (qui n'est pas de -1 car le Pkr est en réalité de 8 environ) mais si on ne vous donne RIEN (comme c'est le cas de cet exo) il faut bien le considérer comme NEUTRE et pas comme ACIDE j'insiste parce qu il s'était embrouillé quand il vous l a expliqué en cours et qu il voulait que vous le reteniez comme je te le dis^^

Médéric MICHEL, tuteur qualifié en UE1-TIG

Par Bakamed le 19/11/2012 à 22h40 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Sunnny
Membre
Médecine Nîmes
Merciii beaucoup !!!
Par Sunnny le 19/11/2012 à 22h49 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Sunnny
Membre
Médecine Nîmes
Bonjour

Je relance pour le même peptide MEDECINE mais cette fois ci à PH=3. C'est un exo tiré des annaales de Lehman
Quelle est la valeur la plus proche de la charge globale de MEDECINE à PH=3? (Pour simplifier le calcul on considèrera uniquement les fonctions amines et carboxyliques avec des pK de 9,5 et de 2,5

Je n'arrive pas à trouver le bon résultat soit -2,8

Merci de bien vouloir m'aider
Par Sunnny le 01/12/2012 à 10h26 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Bakamed
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Salut salut!^^ Attention c'est pas le même peptide, un c'est MEDECIN l autre c'est MEDECINE ça a son importance pour le calcul de la charge^^

Ici ce qui est important à piger c'est que Lehmann te dit bien dans cet item qu on considère TOUTES les fonctions carboxyliques comme un Pk de 2.5, c'est à dire qu en gros ici il considère les Pkr des chaines latérales comme des Pka!!!!

On commence par la fonction aminée qui est celle au début du peptide:
Ici tu es à plus de 2 unités en dessous du Pkb ( 3<9.5) donc tu es à 100% sous forme NH3+ donc charge +1

Ensuite il y a donc ici 5 fonctions COOH/COO- qui sont les 4 des chaînes latérales de E, D, E, E ainsi que l'extrémité C-terminale du peptide!! Rappelle toi bien qu'ils considère dans cet item que les 5 ont le même Pk de 2.5!!!

PH = Pk + log (COO-/COOH)
Donc (COO-/COOH)= 10^(3-2.5)= 3.16 environ
Tu veux la charge du peptide donc tu veux savoir les COO-, pas les COOH.
COOH= 1-COO-
On fait un produit en croix:
COO-= (1-COO-)x 3.16
1COO-= 3.16 - 3.16COO-
4.16COO-=3.16 donc COO-= 0.76 environ donc chacune des 5 fonctions carboxyliques aura une charge de -0.76

Au final on additionne toutes les charges: +1 + (5x-0.76)= -2.8!!!!!^^

Voilà^^ en gros il faut calculer la charge de la seule amine, puis la charge des 5 carboxyliques (en comprenant qu il considère dans cet item qu elles ont même Pk!!!) et les additionner!^^

C'est ok?^^


Médéric MICHEL, tuteur qualifié en UE1-TIG

Par Bakamed le 01/12/2012 à 11h36 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Sunnny
Membre
Médecine Nîmes
Tes explications sont tjrs au TOP. J'te remercie heureux
Par Sunnny le 01/12/2012 à 13h05 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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