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[UE 1] Peptides et protéines | Séance 5 | Pourquoi cette justification ?(Résolue)

Question

...
Albertine
Membre
Médecine Nîmes
Bonjour je bloque sur un item de cet énnoncé : Soit un hexapeptide dont on connaît les données suivantes :
- Il absorbe les ondes électromagnétiques de longueur d’onde 280nm
- Son hydrolyse à chaud par HCl produit 5 acides aminés différents
- Une carboxypeptidase permet d’obtenir un acide aminé achiral libre
- Il possède un acide aminé à 2 carbones asymétriques
- Son clivage par une trypsine donne un tétrapeptide qui peut être N-glycosylé
- Avec CNBr on obtient un pentapeptide non soufré
a) Il est impossible d’obtenir la séquence exacte de ce peptide avec les données fournies.
b) La chymotrypsine permet d’obtenir un tétrapeptide qui migre vers la cathode en électrophorèse sur papier
c) Le 4e résidu peut être Y.
d) Le peptide peut avoir été obtenu par clivage de la partie N-term d'une protéine native.
e) La protéine ne peut pas être myristoylée.
f) Toutes les propositions précédentes sont fausses.

D'après les indications on, obtient le petide : M-(K/R)-N-W-T-G

et je ne comprend pas la d) dont la correction est :Vrai : car l’acide aminé en position N-term est bien une méthionine.

Je sais que le M est tjs le premier acide aminé d'une protéine qui se forme. alors déjà je voulais savoir si une protéine native est une protéine mature un nouvellement forméé ?

Et en fait je ne comprend pas la justification de l'item Admettons que la protéine soit M-M-(K/R)-N-W-T-G le clivage la la N-ter donne bien l'hexapeptide pqe on a une Méthionine en N-ter mais dans la protéine native et avec cette correction je comprend que certes c'est vrai mais parce que le premier aa de l'hexapeptide est une Méthionine or ça on s'en fou ? Je sais pas si ma question est claire mais j'aimerai que l'on me détaille la corection de cet item d, merci !
Par Albertine le 27/09/2012 à 15h58 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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CelineWake
Tuteur simple
Médecine Montpellier
L'item est :

d) Le peptide peut avoir été obtenu par clivage de la partie N-term d'une protéine native.

ça veut dire que t'as une protéine native ( qui n'a subit aucun réarrangement ), tu l'as coupe et tu garde la partie N-term, c'est à dire le début.

Donc à la base tu as une protéine du style : M-(K/R)-N-W-T-G-( plus plein d'autres Acides aminés )

Ta protéine clivée commence par une méthionine du coup elle peut représentée la partie Nterm d'une protéine plus longue.

J'espère que c'est clair

Céline Bruneau, tutrice stagiaire en UE1

Par CelineWake le 01/10/2012 à 06h48 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Albertine
Membre
Médecine Nîmes
Haaaa je crois que j'ai compris on a la partie qui a été clivée pas ce qu'il reste, enfin on a le tout début de la protéine. Je pensais que si la partie N-ter était coupée on avait plus la methionine dans ce qu'il restai du coup c'était incohérent ! Bref juste un petite précision sur protéine native dans le cours il dit " protéines natives (protéines dans leur conformation fonctionnelle) quatre niveaux de structure." Donc pour moi c'est une protéine qui a subit des modifications post trad pour acquérir sa fonctionnalité...donc des réarrangements et qui n'est pas une simple séquence d'aa dans leur structure primaire ...
Par Albertine le 01/10/2012 à 17h26 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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CelineWake
Tuteur simple
Médecine Montpellier
oui tu as raison je me suis mal exprimée, ça veut dire qu'elle n'a pas encore été clivée

Céline Bruneau, tutrice stagiaire en UE1

Par CelineWake le 01/10/2012 à 17h49 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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