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[UE 1] Lehmann | Peptide | Calcul ph...(Résolue)

Question

...
piix
Membre
Médecine Montpellier
Bonjour,

Un qcm disant,
Peptide A-W-R-M-P-D-W-M-W-H-Q
après traitement au bromure de cyanogène, fragments obtenu sont dépose sur une colonne échangeuse de cations à ph= 4.5 puis lavé avec le mm tampon.

on donne pK(Ct)= 3.9 et pK(Nt)=9.5 pour tout les fragments
Et pK(R)=12.5 pK(D)= 3.9 pK(H)= 6

a) seuls 2 fragments pourront être retenus par la résine a pH 4.5


Donc dans la correction il calcul chaque fragment avec par exemple pour celui coté Nter : phi = (pk(R) + pk(Nt))/2
je comprend...

mais pour celui coté Cter ils ont pris pk(H) (ok) et pk (Nt) pourquoi?

Merci beaucoup d'avance pour vos explication sur ce type d'exos...
Par piix le 10/12/2011 à 17h33 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

...
Bakamed
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Les 3 peptides libérés sont:
Nterm-AWRM-Cterm
Nterm-PDWM-Cterm
Nterm-WHQ-Cterm

Le but est de trouver quels PEPTIDES sont des CATIONS à PH=4.5 car ce sont ceux là qui seront retenus. Pour savoir ça il faut trouver le PHi des PEPTIDES (et non des acides aminés).

Le raisonnement est le suivant:

un peptide acide a un PHi entre le Pka de son extrémité et le Pkr de ses acides aminés acides. Un peptide basique a un Phi entre le Pkb de son extrémité et le Pkr de ses acides aminés. Un peptide qui a que des acides aminés neutres a un Phi de 6.

AWRM est plutot basique (avec le R) donc son PHi se situera entre (au milieu de) son Pkb et le Pkr de R, il est donc égal à 10.75: le peptide a donc un PHi>PH il est donc chargé +.

PDWM est plutot acide à cause du D donc il a son Phi entre le Pka et le Pkr du D, il est donc égal à 3.9 il est a donc PHi<PH il est donc chargé -

WHQ est plutot basique avec son H, il a donc le Phi entre son Pkb et le Pkr de l'histidine, il est donc égal à 7.75 donc PHi>PH donc la charge est +

Donc au final 2 peptides sont des cations donc 2 sont retenus.

Médéric MICHEL, tuteur qualifié en UE1-TIG

Par Bakamed le 10/12/2011 à 22h57 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
...
piix
Membre
Médecine Montpellier
Parfait. Je te remercie beaucoup !
Par piix le 11/12/2011 à 08h38 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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