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[UE 1] lehman/ acide aminé | acide aminé | question TD(Résolue)

Question

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vicck
Membre
Médecine Nîmes
bonjour,

j'ai une question un peu bete, mais je ne sais pas quand est ce qu'un aa est chargé +1 ou -1
ex au TD5 question 4b on a une charge + car on a le NH3 et 1 charge - car on a le COO- term
mais est ce qu'il y a que le E qui est chargé -1 ou il y a d'autres aa ??

merci beaucoup
Par vicck le 05/12/2011 à 11h08 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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antoine
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Salut,
Pour calculer la charge d'un acide aminé, il faut d'abord identifier les fonctions COOH/COO- et NH2/NH3+ libres (non engagées dans une liaison peptidique) de l'acide aminé, puis calculer le % de formes chargées (COO- et NH3+) par l'équation d'handerson-haselbach ; et enfin faire la somme des charges obtenues.

Donc ATTENTION, un acide aminé n'a pas toujours la même charge (dépend du pH, du fait que ses fonctions sont engagées dans une liaison peptidique). A pH physiologique (=7) et sous forme libre, les acides aminés acides E et D une charge de -1 (deux fonctions COO- à 100% et une fonction NH3+ à 100% -> 2x(-1) + 1 = -1 )

Un exemple pour s'entrainer : QCM 2 de la séance 5 du tuto
Par antoine le 05/12/2011 à 11h28 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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vicck
Membre
Médecine Nîmes
d'accord merci !
j'ai une autre question au passage !
dans la question 11 item a de la séance 5 du tuto, quand ils nous demandent la charge du glutathion...
je vois pas pourquoi la charge est nulle !

je pensais que : fonction carboxylique ph = pk = 3 donc la charge est de 0.5 (ou -0.5?)

aprés pk > ph pour les deux autres fonctions et puis sont sup à + de deux unités donc totalement pour la fonction thiol = 0 car sous forme SH et pour la fonction aminée +1

donc là je vois pas ou je me suis plantée !

et j'ai aussi une autre question, si t'as le temps de m'expliquer ca serait cool sinon c'est pas grave! c'est par exemple la question 12 item b de la séance 5 du tuto, en fait je comprends rien quand il faut compter le nombre de cys, par rapport aux chaines peptidiques ! je suis larguée sur ca!

merci beaucoup pour la rapidité!
Par vicck le 05/12/2011 à 15h13 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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antoine
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Attention : le gluthation possède 2 fonctions carboxyliques libres. Comme pH=pK, la fonction COO- est présente à 50% (=> 2 charges de -0,5)
Fonction NH3+ à 100% => charge +1
+1-2x0,5 = 0


Il ne faut pas compter le nb de cys, mais le nombre de chaines peptiques minimales. La consigne t'indiques que tu as une protéine à 3 SU (sous-unités), toutes de 100kDa, et composées de chaines peptidiques de 100, 50, 20, et 10 kDa. (Indique qu'il y a AU MOINS une chaine peptidique pour chaque poids moléculaire différent).
Le cas pour lequel il y a le moins de chaines peptidiques est : 2 SU comportants une chaine de 100kDa ; et 1 SU comportant 4 chaines de 50, 20, 20 et 10 = 100 kDa. -> cela fait 6 chaines peptiques (avec les données que tu as tu ne peut pas en utiliser moins).
Par antoine le 05/12/2011 à 15h27 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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vicck
Membre
Médecine Nîmes
a ok j'avais pas compris qu'il y avait deux SU de 100KDa!
merci beaucoup beaucoup beaucoup !
Par vicck le 05/12/2011 à 15h37 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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