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[UE 2] Delbecq/Appareil de Golgi | ... | Comment résoudre un exercice ?(Résolue)

Question

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Nana
Membre
Médecine Montpellier
Bonsoir,

Voilà, je suis en train de refaire le TD n°3 de M.Delbecq, et je bloque complètement sur une question, il s'agit du QCM 8. Comment fait-on pour résoudre cet exo : comment calculer de PM avec les infos que l'on nous donne. Y a-t-il des choses à savoir au préalable avant de résoudre cet exercice ?

Si vous pouviez m'aider ! Car j'ai vu qu'un exo de ce type était tombé au concours l'an dernier, et si cette année je me retrouve confrontée au même type d'exo, et bien je ne saurai pas le résoudre !

Merci d'avance, bonne soirée heureux
Par Nana le 26/11/2011 à 22h10 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Ca_Lime
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Bonjour,

La résolution du qcm ne nécessite que les notions du cours de Delbecq.

Ça pourrait peut-être t'aider de d'abord imaginer/dessiner l'insertion de la proteine dans la membrane du R.E(simulé par les microsomes) en identifiant les portions luminales, cytosoliques et membranaires:
  • On repère d'abord le signal d'adressage (=1er domaine hydrophobe), ici N-ter.
  • Puis en fonction de l'orientation du domaine d'adressage dans la mb du RE, la portion qui suit sera luminale ou cyosolique.
    Pour un domaine d'adressage N-ter la portion qui suit est toujours luminale (si 1er domaine transmembranaire cf répartition des charges)
  • Repérer les signaux d’arrêt et début de translocation. Donc ce sont les domaines HB suivants. Lorsque la portion qui les précède est luminale il s'agit d'un signal d’arrêt (et de début si portion cytosolique)
  • Dessiner entièrement la protéine insérée dans la membrane du R.E/microsome avec ttes les portions luminales, cytosoliques et transmembranaires (n'oublie pas qu'un domaine d'adressage N-ter est tjrs clivé)

Donc il en ressort pour notre protéine de 70 kDa, en présence de microsomes:
-Séquence N-ter clivée (-2kDa)
-La portion de 50 kDa est luminale N.B: les étoiles représentent des séquences de N-glycosylation, il est important de vérifier qu'elles sont bien luminales cad qu'elles pourront bien être glycosylees en presence de sucres (mannose)
-Sequence HB de 3 kDa transmembranaire
-Portion de 15 kDa cytosolique
Donc en l'absence de glucide et en présence de microsomes, la protéine fait bien 68 kDa.

Ensuite, comprendre à quoi servent les ingrédients du tableau et ce qu'ils changent au niveau du PM:
-les microsomes: permettent la translocation de la prot et donc le clivage de la séquence N-ter (-2kDa) et la glycosylation (+ PM des N-oligosaccharides)
-la méthionine radioactive permet tout simplement le marquage radioactif de la prot donc n'implique rien pour son PM
-le mannose tritié permet de marquer radioactivement le mannose et ne change pas le PM non plus
N.B il y a tjrs du mannose et de la methionine dans le milieu, ce qui change c'est qu'ils soient radioactifs ou pas

Il est donc tout à fait logique que le PM de 70 kDa ne change pas en absence de microsomes car il n'y a ni clivage ni glycosylation.
En revanche on voit que le PM augmente en leur présence: on sait que la séquence N-ter de 2 kDa a été clivée, on en deduit donc que PM des N-oligosaccharides=75-68=7 kDa

Pour l'item D: l'addition d'une protéase en présence de microsomes permet de degrader les portions cytosoliques de la prot (le reste étant protégé à l’intérieur des microsomes avec les N-oligosaccharides), donc PM(final)=75-15=60 kDa

Et voila je crois avoir répondu à tous les items
J’espère t'avoir éclairée!
Bon courage heureux

Tuteur stagiare en UE 2 (cytologie/histologie/biocell) à l'UFR Médecine de Montpellier


Par Ca_Lime le 27/11/2011 à 02h50 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Nana
Membre
Médecine Montpellier
Super !!! Merci beaucoup d'avoir pris le temps de me répondre !!
heureux
Par Nana le 27/11/2011 à 18h25 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Nana
Membre
Médecine Montpellier
Encore moi heureux

Voilà, je suis en train de faire le QCM du concours de l'an dernier où ce type d'exo est sorti, et j'aurai voulu savoir si tu aurais pu me dire si j'ai bon ou pas ? Mais je ne sais pas si tu as l'énoncé ?

A) Vrai
B) Vrai, car on enlève l'extrémité Nter, donc 42-2= 40
C) Vrai, car modif post traductionnelle ?
D)Faux, car on enlève 15 à 42 ce qui fait 27kda
E)Faux, car comme tu m'as dis, on doit vérifier que les petites étoiles sont dans le côté luminal, or là, elles sont dans le côté cytosol, donc la protéine ne pourra pas être N glycosylée

Voilà si tu pouvais me dire !
Merci d'avance !! heureux
Par Nana le 27/11/2011 à 19h50 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Ca_Lime
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Re,

C) Faux. La translocation est co-traductionnelle donc il n'y a plus de modifications de la prot si on ajoute des microsomes après la traduction.

D) on enleve 15 à 40 (le signal N-ter est clivé dans les microsomes) la masse de la prot sera de 25 kDa.

Voila heureux sinon tu as l'air d'avoir compris
Bon courage avec tes révisions!

Tuteur stagiare en UE 2 (cytologie/histologie/biocell) à l'UFR Médecine de Montpellier


Par Ca_Lime le 27/11/2011 à 20h09 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Nana
Membre
Médecine Montpellier
Ahhh oui exact pour la D, étourderie de ma part heureux

Vraiment un grand, grand merci de m'avoir corrigée et répondue aussi rapidement !!
Vous faites un super travail !! oeil
Par Nana le 27/11/2011 à 20h37 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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