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[UE 1] Lehmann (intégral) | / | Questions sur un peu tout(Résolue)

Question

...
Thirawen
Membre
Médecine Montpellier
Salut!

Premièrement je voudrais m'excuser pour la longueur du message mais en refaisant le cours de notre cher Lehmann ainsi que son ED et vue sa réponse à mes questions, je me permets de les reposer ici :)

1) Au QCM 18 item C de son ED il pare de liaisons hydrophiles, ce serait une allusion aux liaisons hydrogènes ou est-ce un autre type de liaisons?

2) A l'oral il a précisé que la filtration permet la purification mais pas la concentration, mais si on purifie (et donc enlève des déchets), on va réduire le volume et donc concentrer la solution. Je ne comprend donc pas comment on peut dissocier ces deux fonctions.

3) Au QCM 7 item D, à propos de la synthèse de l'adrénaline, il semblerait que pour lui elle soit uniquement synthétisée au niveau de la glande surrénale hors vu qu'on la retrouve dans le cerveau et que la barrière hémato-encéphalique empêche les molécules de passer, ne doit-on pas dire qu'elle est aussi synthétisée au niveau du cerveau?

4) A l'oral il a mentionné qu'une tumeur au niveau des surrénales va augmenter la présence de catécholamines, qui est repérable par l'augmentation de l'acide vanylmandélique, mais peut-on également voir cette augmentation dans le cerveau et donc repérer un cancer du cerveau par cette méthode?

5) Lors d'une électrophorèse bi-dimensionnelle, est-il possible d'observer des différences de sous-unités (donc sans employer d'agents réducteurs comme le BME) ou est-ce utilisé seulement pour étudier les chaines (avec BME)?

6) Après acétylation d'une lysine, est-il toujours possible que la trypsine coupe après celle-ci ou est-ce que cette modification post-traductionnelle empêche son action car la lysine ne serait plus reconnue?

7) Lors d'une chromatographie par affinité, la protéine utilisée (présentant un épitope) doit-elle être fragmentée en plusieurs peptides pour que l'on puisse connaître la composition exacte de celle-ci où le fait que ce soit un épitope permet de connaître la structure primaire de la protéine entière?

Encore désolé si ça fait beaucoup de questions à répondre, mais merci d'y avoir prêté attention!
Par Thirawen le 09/12/2014 à 22h06 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponse

...
Muspel
Tuteur simple
Médecine Nîmes
Bonsoir =)
"Une" question bien présentée et sans fautes : je vais me faire un plaisir de te répondre oeil

1) Au QCM 18 item C de son ED il pare de liaisons hydrophiles, ce serait une allusion aux liaisons hydrogènes ou est-ce un autre type de liaisons?


J'ai pas son ED confus
T'aurai moyen de me recopier l'item ?

Mais sinon oui, à mon avis il parle des liaisons hydrogènes.


2) A l'oral il a précisé que la filtration permet la purification mais pas la concentration, mais si on purifie (et donc enlève des déchets), on va réduire le volume et donc concentrer la solution. Je ne comprend donc pas comment on peut dissocier ces deux fonctions.


Une filtration ne réduit pas le volume, on enlève juste les particules autres que celles qui nous intéressent (la toute petite variation de volume liée à ça est infinitésimale et carrément négligeable).
Du coup on purifie bien heureux
Retiens que
  • Toutes les méthodes permettent une purification, sauf la lyophilisation et l'ultracentrifugation
  • Toutes les méthodes permettent une concentration sauf la dialyse

3) Au QCM 7 item D, à propos de la synthèse de l'adrénaline, il semblerait que pour lui elle soit uniquement synthétisée au niveau de la glande surrénale hors vu qu'on la retrouve dans le cerveau et que la barrière hémato-encéphalique empêche les molécules de passer, ne doit-on pas dire qu'elle est aussi synthétisée au niveau du cerveau?


Elle circule via la circulation sanguine, donc se retrouve partout rire
Elle est synthétisée par les cellules chromaffines des surrénales et par les neurones.


4) A l'oral il a mentionné qu'une tumeur au niveau des surrénales va augmenter la présence de catécholamines, qui est repérable par l'augmentation de l'acide vanylmandélique, mais peut-on également voir cette augmentation dans le cerveau et donc repérer un cancer du cerveau par cette méthode?


Non, par contre l'explication de ce phénomène sort du cadre du cours (oui, c'est lui qui en a parlé mais bon...). Tu comprendras tout ça en UE6 au second quad.

5) Lors d'une électrophorèse bi-dimensionnelle, est-il possible d'observer des différences de sous-unités (donc sans employer d'agents réducteurs comme le BME) ou est-ce utilisé seulement pour étudier les chaines (avec BME)?


Autant l'utilisation de SDS est fondamentale (sinon on a un biais pour obtenir les poids moléculaires), autant j'aurai tendance à dire que ça agent réducteur ça pourrait marcher (mais c'est simplement mon point de vue).

6) Après acétylation d'une lysine, est-il toujours possible que la trypsine coupe après celle-ci ou est-ce que cette modification post-traductionnelle empêche son action car la lysine ne serait plus reconnue?


C'est une excellente question, à laquelle je n'ai hélas pas la réponse confus
Je ne me l'étais jamais posée mais je la trouve très pertinente.
Si un autre tuteur a la réponse il te répondra à la suite de mon message, sinon essaye de voir directement avec l'un d'eux heureux

7) Lors d'une chromatographie par affinité, la protéine utilisée (présentant un épitope) doit-elle être fragmentée en plusieurs peptides pour que l'on puisse connaître la composition exacte de celle-ci où le fait que ce soit un épitope permet de connaître la structure primaire de la protéine entière?


On utilise qu'un épitope, qui est sensé ne reconnaître que ce qu'on cherche. Après je pense que ce n'est pas fiable à 100% et qu'il faut en faire plusieurs.

J'espère avoir correctement répondu à ce que tu avais en tête ! heureux

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

Par Muspel le 10/12/2014 à 00h54 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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