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[UE 1] Nucléotides, Réplication | Biosynthèse de Novo / Réplication | Problème Séance 2011-2012 (Tuteurs remerciés)

Question

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StevenMa
Membre
Médecine Nîmes
Bonjour, je rencontre un petit soucis au niveau de cette séance :
http://www.lafed-um1.fr/statique/archives/2011-2012/UE1-annee20112012/UE1-s9.pdf
http://www.lafed-um1.fr/statique/archives/2011-2012/UE1-annee20112012/UE1-c9.pdf

Au niveau du QCM5 item A : Je ne comprends pas trop pourquoi l'item est compté vrai... C'est un peu exagéré le "directement" non...? Y'a quand même une dizaine de réactions avant que l'AMP et GMP apparaissent, notamment le passage par IMP et XMP pour la GMP...
Est-ce que ce genre d'item serait possible au concours? Car en lisant ça je me suis dit que le directement était de trop...

Sinon, dans l'item D, je ne comprends pas pourquoi la réduction du ribonucléotide en désoxyribonucléotide est irréversible... On ne peut pas passer de l'un à l'autre ? Une fois qu'on est en désoxy c'est terminé? On ne peut plus redevenir ribonucléotide?

Ensuite, L'item du QCM8
"La synthèse du brin retardé s’opère simultanément avec celle du brin avancé." est compté juste.
Est-ce qu'on peut dire que la synthèse du brin retardé s'opère en même temps que celle du brin avancé, mais avec un certain retard dû à la synthèse des fragments d'Okazaki?

Enfin, pour l'item 13B, on nous parle d'ADN polymérase II alors que Badia n'en parle pas du tout dans son cours... Donc est-ce que c'est juste parce que ça a été retiré du cours depuis 2011? J'avais mis faux du coup vu que je pensais que l'ADN pol II n'existait pas... ^^

Merci pour votre patience !!
Par StevenMa le 08/12/2014 à 15h12 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Muspel
Tuteur simple
Médecine Nîmes
Bonjour =)

Au niveau du QCM5 item A : Je ne comprends pas trop pourquoi l'item est compté vrai... C'est un peu exagéré le "directement" non...? Y'a quand même une dizaine de réactions avant que l'AMP et GMP apparaissent, notamment le passage par IMP et XMP pour la GMP...
Est-ce que ce genre d'item serait possible au concours? Car en lisant ça je me suis dit que le directement était de trop...


Mme Mary dit clairement qu'une des différences entre les purines et les pyrimidines est que les purines se font directement sur le ribose, alors que C et T sont "branchées" une fois fabriquées.
C'est pas directement en terme d'étapes mais en terme de localisation.
Donc oui, un item comme ça est tombable (et je dirai même avec une bonne proba)

Sinon, dans l'item D, je ne comprends pas pourquoi la réduction du ribonucléotide en désoxyribonucléotide est irréversible... On ne peut pas passer de l'un à l'autre ? Une fois qu'on est en désoxy c'est terminé? On ne peut plus redevenir ribonucléotide?


Non, et c'est même une bonne chose : ça permet d'éviter tous les pb d'ADN qui deviendrait de l'ARN et inversement.

Ensuite, L'item du QCM8
"La synthèse du brin retardé s’opère simultanément avec celle du brin avancé." est compté juste.
Est-ce qu'on peut dire que la synthèse du brin retardé s'opère en même temps que celle du brin avancé, mais avec un certain retard dû à la synthèse des fragments d'Okazaki?


Non ça se fait bien en même temps, si il y avait du retard au fur et à mesure le brin retardé ne pourrait pas suivre l'hélicase et il y aurait au bout d'un moment un sacré décalage.
N'oublie pas qu'il n'y a pas qu'une ADN polymerase.

Enfin, pour l'item 13B, on nous parle d'ADN polymérase II alors que Badia n'en parle pas du tout dans son cours... Donc est-ce que c'est juste parce que ça a été retiré du cours depuis 2011? J'avais mis faux du coup vu que je pensais que l'ADN pol II n'existait pas... ^^


Elle existe mais il n'en parle pas cette année (mais il y a quand même une ligne expres dans son tableau). Là il faut avoir un peu de recul sur l'item et se dire que si pol. 1 et pol. 3 existe il doit bien exister une pol. 2 quelque part (au passage il existe même pol 4 et 5 oeil)
Attention à ne pas chercher les pièges trop loin ! Ce n'est pas du tout le genre de Mr Badia.

Bon courage ! heureux

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

Par Muspel le 08/12/2014 à 17h02 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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StevenMa
Membre
Médecine Nîmes
Merci pour ces réponses !

Du coup, comme la base T est formée à partir de dUMP sous forme de dTMP, le dTMP ne peut pas devenir TMP ? le TMP, TDP, TTP existent quand même du coup et sont formés d'une autre façon ou pas du tout?

Pour ma question sur le retard du brin retardé, en fait il n'est pas en retard car plusieurs ADN polymérases peuvent synthétiser la toute nouvelle portion avec la toute nouvelle amorce qui vient d'apparaitre au niveau de la fourche, et en même temps finir de synthétiser le dernier fragment d'Okazaki? Je n'y avait pas pensé, mais ça parait logique en effet... ^^

Par StevenMa le 08/12/2014 à 17h32 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Muspel
Tuteur simple
Médecine Nîmes
Si si ils existent bien, regarde diapo 60 du cours heureux
Mais en effet ce n'est pas le même processus. Ta question d'avant portait sur la fabrication des bases (biosynthèse de novo), qui nous fait obtenir de l'UMP. A partir de ça on passe à une autre phase (celle de la diapo 60) qui nous permet de passer à C ou T, et de changer entre les mono, di ou tri phosphates.

Je peux pas te faire de topo ici, mais si jamais tu as vraiment du mal passe mercredi en QR oeil

C'est pas vraiment dit dans le cours mais ça me paraît logique.
Normalement Mme Mary vous a montré des vidéos sur ça en cours non ? Rappelle toi que ça enchaînait plutôt vite.
En gros il est en retard mais le comble à chaque fois (sinon t'es d'accord que ça poserait quelques pb oeil)

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

Par Muspel le 08/12/2014 à 21h59 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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StevenMa
Membre
Médecine Nîmes
Oui, j'avais bien compris le système des Nucléosides kinases qui font passer de ATP à ADP etc.
Mais comme on obtient du dTMP, on pourra faire du dTDP et du dTTP je suis d'accord ! Mais le TDP et TTP sans le "désoxy", on ne les obtient pas de cette manière ou ils n'existent pas? Car vu qu'on peut pas passer de "désoxy" à "oxy" avec la Ribonucléotide Réductase, ça parait logique du coup?

Merci à vous les tuteurs en tous cas ! Vous êtes au top !
Par StevenMa le 08/12/2014 à 22h24 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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Muspel
Tuteur simple
Médecine Nîmes
Mmmmmh tu pars un peu loin, ça sort un peu du cadre du cours.
Là je vais pas te mentir, je ne sais pas quoi te répondre pour ne pas te raconter de bêtises.
Essaye de creuser si vraiment ça t’embête, peu être via d'autres tuteurs, mais à 10 jours du concours je pense que ce n'est pas judicieux de s'attarder sur des détails qui ne sont clairement pas de l'ordre du cours tels quels.
Tu as compris ces phénomènes, tels que Mme Mary l'entend et c'est l'essentiel. Ni t'y attarde pas plus sauf pour faire des QCM : je cherche pas à te mettre la pression mais 50% de ce que tu auras en tête au concours ce joue maintenant oeil

Après je sais aussi que de petites choses comme ça peuvent nous embrouiller et les résoudre peut aider à comprendre encore mieux. Alors c'est à toi de voir heureux

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

Par Muspel le 09/12/2014 à 00h08 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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StevenMa
Membre
Médecine Nîmes
C'était juste de la curiosité, je ne me prends pas la tête avec ça, je suis déjà passé à autre chose ne t'inquiètes pas ^^
Merci pour tes conseils !
Par StevenMa le 09/12/2014 à 00h46 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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