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[UE 1] Protides | Lehmann | Analyse électrophorèse(Tuteurs remerciés)

Question

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wil96
Membre
Médecine Nîmes
Bonjour,
je me permets de relancer plus ou moins une question que j'ai déjà posé, on m'a expliqué certaines choses, mais je reste en partie bloqué, alors voila, c'est sur l'analyse d'électrophorèse.
Alors est-ce que c'est bon:
en condition dénaturante on casse les liaisons faibles, donc on sait si on aura une protéine manométrique ou polymérique, néanmoins on peut avoir pls monomères, sa nous donne pas le nombre précis et la je comprends pas car à ce moment elle sera. Sa nous permet aussi d'assurer quelle possède une structure quaternaire si elle possède pls traies en dénaturante mais je sais pas pourquoi.
Et avec le réducteur sa nous donne les combinaisons possibles pour former les monomères que l'on aura vu en dénaturante, du coup se doit être les chaînes que l'on a.

Merci au tuteur qui prendra le temps de me répondre et désolé pour se pavé=)
Par wil96 le 24/10/2014 à 17h40 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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pierrebernez
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Salut!

t'inquiètes pas, la FAQ c'est fait pour ça heureux

J'essaie de tout te ré-expliquer en répondant à tes problèmes:

En condition dénaturante:


On casse les liaisons faibles.
Les monomères de la protéines sont donc séparés les uns des autres.

Quand on voit une barre sur l'électrophorèse, ça veut dire qu'on a un ou plusieurs monomère(s) pesant le même poids moléculaire (monomères identiques du coup).

Si on voit deux barres sur l'électrophorèse, ça veut dire qu'on a deux types de monomères, mais on n'a toujours pas d'information sur le nombre de chacun des monomères. On sait juste qu'il y en a au moins un pour chaque barre sur l'électrophorèse.

Du coup, une simple électrophorèse en conditions dénaturante permet pas de dire si on a plusieurs monomères (donc une structure quaternaire). Mais si on a le PM de la protéine, on pourra dire combien sont les monomères. par exemple, une protéine de 160 kDa avec une seule barre en condition dénaturante à 80kDa, ça veut dire qu'on a deux monomères de 80kDa pour former notre protéine, et donc une structure quaternaire !

En condition dénaturante ET avec un agent réducteur



On a cassé les liaisons faibles (avec l'agent dénaturant).
On a aussi cassé les ponts disulfures (avec l'agent réducteur).

On a donc toutes les chaînes polypeptidiques constitutives de notre protéine, qui sont séparées les unes des autres.

Si on voit une barre sur l'électrophorèse, ça veut dire qu'on a une ou plusieurs chaîne(s) pesant le même poids moléculaire.

Si on voit deux barres sur l'électrophorèse, ça veut dire qu'on a deux types de chaînes, mais on n'a toujours pas d'information sur le nombre de chacune des chaînes. On sait juste qu'il y en a au moins un pour chaque barre sur l'électrophorèse.

voilà
!


Par pierrebernez le 24/10/2014 à 18h18 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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wil96
Membre
Médecine Nîmes
Merci c'est vraiment top!!!! sa m'a éclaircis, j'ai vraiment bien compris ton explicationqui est vraiment claire!!
Juste pourrais me préciser un plus pourquoi c'est quaternaire et non tertiaire par exemple?
Par wil96 le 24/10/2014 à 18h33 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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wil96
Membre
Médecine Nîmes
Et aussi du coup, pourrais-tu me dire si c'est bon, càd par rapport au QCM 2 de l'ED, sa m'a permis de le faire, mais j'ai pas la correction.

Pour la A, vraie, ex: 220 kDa, pour Pe, 2 monomères de 100 et 2 de 60. Pour Pf, 2 de 100 et 3 de 40.

Pour la B, je pense que c'est vraie, si Pf est dimérique alors elle a qu'un monomère de 100 et de 40 donc un total de 140 kDa, ce qui est inférieur au 160 kDa de Pe.

Pour la C, c'est vraie, elle contient au moins 5 ponts disulfure pour respecter l'énoncer donc au moins 10 cystéines du coup pour arriver à un poids de minimums 140 kDa.

Pour la D, je dirais vraie aussi, car cela dépend de la charge est cela peut être possible même si l'on a aucune information sur cela.

Pour la E, je pense que c'est aussi vraie, on pourrait avoir 3*100+2*60 donc 5 sous-unités.
Merci heureux
Par wil96 le 24/10/2014 à 19h11 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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pierrebernez
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Une protéine a une structure quaternaire quand elle a plusieurs monomères qui la constituent, c'est à dire quand c'est une protéine polymérique. Par contre toutes les protéines ont une structure terciaire, c'est leur structure fonctionnelle. Je sais pas si ça répond bien à ta première question.

Ensuite, pour le QCM du TD:

Pour la A, vraie, ex: 220 kDa, pour Pe, 2 monomères de 100 et 2 de 60. Pour Pf, 2 de 100 et 3 de 40.




Pour la B, je pense que c'est vraie, si Pf est dimérique alors elle a qu'un monomère de 100 et de 40 donc un total de 140 kDa, ce qui est inférieur au 160 kDa de Pe.

oui c'est bon (vu que 160kDa c'est le plus petit poids moléculaire que Pe peut avoir).




Pour la C, c'est vraie, elle contient au moins 5 ponts disulfure pour respecter l'énoncer donc au moins 10 cystéines du coup pour arriver à un poids de minimums 140 kDa.




Pour la D, je dirais vraie aussi, car cela dépend de la charge est cela peut être possible même si l'on a aucune information sur cela

.



Pour la E, je pense que c'est aussi vraie, on pourrait avoir 3*100+2*60 donc 5 sous-unités.

Oui et c'est même la seule possibilité d'atteindre 420 kDa avec 100 et 60.


C'est bon, t'as bien compris on dirait !

(pour le QCM du TD j'avais pas la correction, j'ai juste relu mais tout m'a l'air OK comme je te l'ai écrit heureux )

Courage pour la suite!
Par pierrebernez le 24/10/2014 à 21h34 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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wil96
Membre
Médecine Nîmes
Encore merci, parce que vraiment ça me bloqué vraiment depuis quelques jours, et en un message, j'ai compris!!!!!
Par contre, j'ai tjs une question, pour le tertiaire, j'ai compris la définition mais je vois tjs pas pourquoi on peut pas dire que c'est tertiaire quand pls monomères car c'est peut être la ou je me trompe en pensant que tertiaire peut désigner un assemblage de monomères comme quaternaire?
Merci heureux
Par wil96 le 24/10/2014 à 21h46 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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ATPsynthase
Tuteur simple
Médecine Montpellier
Bonjour !

En fait la structure tertiaire correspond à la vue d'ensemble d'une chaine polypeptidique ou d'un monomère. A partir du moment où l'on a plusieurs monomères, on parle de structure quaternaire.

Bon courage ! :)

" Le chemin est long mais l'arrivée est belle. " - Manuella -

Par ATPsynthase le 25/10/2014 à 15h13 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte
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wil96
Membre
Médecine Nîmes
Ok merci beaucoup à vous deux heureux
Par wil96 le 26/10/2014 à 09h38 - Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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